Kontseiluaren gobernu-organo nagusia bere Batzar Nagusia da, eta lau urtean behin biltzen da 2024tik aurrera.
Batzar Nagusia
Batzar Orokorrak Gobernu Batzordea hautatzen du, lidergo zientifikoa ematen duena eta ikuspegia, misioa, printzipioak eta balioak ematea ahalbidetzen duena, baita Kontseiluaren finantza eta kudeaketa sendotasuna ere.
Gobernu Batzordea
ISCko Gobernu Batzordea, bost ofizialek eta hamar kide arruntek osatua, Batzar Orokorrak bere erabakiak betetzeko agintzen du, ISCko Idazkaritzaren laguntzarekin.
Aholku Organoak
Aholku-organo batzuek Gobernu Batzordeari laguntzen eta aholkatzen diote Kontseiluaren lanaren funtsezko alderdiei eta Gobernu Batzordearen eginkizunei buruz.
Estatutuak eta Barne Araudia
2024ko otsailean ISCren ezohiko Batzar Nagusi elektronikoak onartutako ISCren Estatutuak eta Prozedura Arauak.